Las siglas MGC (Index Herbariorum) corresponden al Herbario depositado en la Facultad de Ciencias y es patrimonio de la Universidad de Málaga.

    En la actualidad está compuesto por más de 78.000 pliegos que se encuentran repartidos en las siguientes colecciones:

COLECCIÓN	Nº PLIEGOS	FAMILIAS	GÉNEROS	Nº TAXONES
Cormófitos (MGC)	70650	236	1517	6740
Algas (MGC-Phyc)	5035	111	322	922
Briofitos (MGC-Briof)	1840	89	212	314
Líquenes (MGC-Lichen)	350	22	51	105

    La de cormófitos es la principal colección del herbario MGC. En ella se incluyen plantas vasculares del Mediterráneo Occidental (España y Marruecos representan el 97.5%), encontrándose representadas plantas de todas las provincias españolas y de multitud de países, siendo los más destacados después de Marruecos, Portugal, Brasil, Italia y Francia entre otras. Dentro de esta colección de cormófitos, cabe destacar también que existen más de 800 pliegos de plantas ornamentales, recolectados en casi su totalidad en la ciudad de Málaga.
    La colección de algas del herbario MGC es de las más importantes en número de la Península Ibérica. Al igual que los cormófitos, la mayoría son algas del Mediterráneo Occidental (España y Marruecos), aunque también encontramos algas de Venezuela, Brasil y Grecia entre otros países. Hay que destacar un gran número de algas de la Isla de Alborán y de la Antártida y una donación de algas japonesas de la Universidad de Kobe (Japón). Hay que prestar una mención especial a varias colecciones históricas de algas en formato de pliegos y de preparaciones microscópicas que incluyen material de hasta más de 200 años.
    Las colecciones de briófitos y líquenes son más modestas en número pero de gran valor ya que la gran mayoría están constituidas por material de la provincia de Málaga.
    Como colección especial destacaremos la existencia de una palinoteca con cerca de un millar de muestras acetolizadas.